Protein–RNA interactions for Protein: P40305

IFI27, Interferon alpha-inducible protein 27, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI27P40305 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI27P40305 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI27P40305 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI27P40305 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI27P40305 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI27P40305 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI27P40305 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI27P40305 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI27P40305 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI27P40305 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI27P40305 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI27P40305 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI27P40305 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI27P40305 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI27P40305 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI27P40305 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI27P40305 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI27P40305 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI27P40305 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI27P40305 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI27P40305 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI27P40305 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI27P40305 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI27P40305 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI27P40305 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI27P40305 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI27P40305 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI27P40305 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI27P40305 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI27P40305 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI27P40305 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI27P40305 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI27P40305 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI27P40305 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI27P40305 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI27P40305 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI27P40305 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI27P40305 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI27P40305 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI27P40305 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI27P40305 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI27P40305 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI27P40305 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI27P40305 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI27P40305 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI27P40305 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI27P40305 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI27P40305 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFI27P40305 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFI27P40305 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFI27P40305 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFI27P40305 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFI27P40305 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFI27P40305 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFI27P40305 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFI27P40305 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFI27P40305 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFI27P40305 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFI27P40305 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFI27P40305 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFI27P40305 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFI27P40305 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFI27P40305 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFI27P40305 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFI27P40305 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFI27P40305 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFI27P40305 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFI27P40305 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFI27P40305 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFI27P40305 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFI27P40305 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFI27P40305 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFI27P40305 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFI27P40305 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFI27P40305 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFI27P40305 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFI27P40305 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFI27P40305 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFI27P40305 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFI27P40305 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFI27P40305 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFI27P40305 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFI27P40305 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFI27P40305 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFI27P40305 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFI27P40305 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFI27P40305 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFI27P40305 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFI27P40305 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFI27P40305 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFI27P40305 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFI27P40305 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFI27P40305 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFI27P40305 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFI27P40305 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFI27P40305 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFI27P40305 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFI27P40305 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFI27P40305 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFI27P40305 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms