Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FDFT1P37268 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FDFT1P37268 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FDFT1P37268 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FDFT1P37268 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FDFT1P37268 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FDFT1P37268 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FDFT1P37268 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FDFT1P37268 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FDFT1P37268 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FDFT1P37268 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FDFT1P37268 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FDFT1P37268 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FDFT1P37268 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FDFT1P37268 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FDFT1P37268 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FDFT1P37268 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FDFT1P37268 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FDFT1P37268 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FDFT1P37268 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FDFT1P37268 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FDFT1P37268 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FDFT1P37268 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FDFT1P37268 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FDFT1P37268 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FDFT1P37268 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FDFT1P37268 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FDFT1P37268 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FDFT1P37268 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FDFT1P37268 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FDFT1P37268 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FDFT1P37268 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FDFT1P37268 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FDFT1P37268 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FDFT1P37268 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FDFT1P37268 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FDFT1P37268 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FDFT1P37268 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FDFT1P37268 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FDFT1P37268 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FDFT1P37268 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FDFT1P37268 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FDFT1P37268 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FDFT1P37268 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FDFT1P37268 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FDFT1P37268 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms