Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT2P35908 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT2P35908 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT2P35908 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT2P35908 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT2P35908 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT2P35908 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT2P35908 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT2P35908 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT2P35908 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT2P35908 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT2P35908 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT2P35908 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT2P35908 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT2P35908 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT2P35908 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT2P35908 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT2P35908 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT2P35908 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT2P35908 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT2P35908 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT2P35908 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT2P35908 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT2P35908 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT2P35908 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT2P35908 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT2P35908 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT2P35908 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT2P35908 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT2P35908 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT2P35908 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT2P35908 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT2P35908 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT2P35908 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT2P35908 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT2P35908 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT2P35908 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT2P35908 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT2P35908 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT2P35908 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT2P35908 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT2P35908 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT2P35908 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT2P35908 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT2P35908 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT2P35908 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT2P35908 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT2P35908 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT2P35908 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT2P35908 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT2P35908 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT2P35908 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT2P35908 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT2P35908 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT2P35908 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT2P35908 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT2P35908 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT2P35908 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT2P35908 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT2P35908 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT2P35908 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT2P35908 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT2P35908 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT2P35908 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT2P35908 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT2P35908 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT2P35908 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT2P35908 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT2P35908 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT2P35908 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT2P35908 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT2P35908 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT2P35908 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT2P35908 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT2P35908 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT2P35908 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT2P35908 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT2P35908 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT2P35908 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT2P35908 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT2P35908 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT2P35908 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT2P35908 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT2P35908 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT2P35908 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT2P35908 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT2P35908 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT2P35908 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT2P35908 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT2P35908 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT2P35908 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT2P35908 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT2P35908 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT2P35908 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT2P35908 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT2P35908 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT2P35908 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT2P35908 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT2P35908 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT2P35908 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms