Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms