Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX2P28328 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX2P28328 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX2P28328 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX2P28328 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX2P28328 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX2P28328 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX2P28328 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX2P28328 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX2P28328 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX2P28328 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX2P28328 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX2P28328 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX2P28328 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX2P28328 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX2P28328 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX2P28328 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX2P28328 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX2P28328 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX2P28328 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX2P28328 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX2P28328 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX2P28328 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX2P28328 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX2P28328 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX2P28328 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX2P28328 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX2P28328 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX2P28328 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX2P28328 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX2P28328 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX2P28328 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX2P28328 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX2P28328 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX2P28328 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX2P28328 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX2P28328 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX2P28328 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX2P28328 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX2P28328 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX2P28328 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX2P28328 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX2P28328 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX2P28328 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX2P28328 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX2P28328 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX2P28328 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX2P28328 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX2P28328 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX2P28328 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX2P28328 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX2P28328 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX2P28328 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX2P28328 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX2P28328 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX2P28328 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX2P28328 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX2P28328 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX2P28328 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX2P28328 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PEX2P28328 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PEX2P28328 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PEX2P28328 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PEX2P28328 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PEX2P28328 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX2P28328 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX2P28328 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX2P28328 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX2P28328 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX2P28328 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX2P28328 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX2P28328 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX2P28328 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX2P28328 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX2P28328 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX2P28328 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX2P28328 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX2P28328 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX2P28328 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX2P28328 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX2P28328 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX2P28328 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX2P28328 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX2P28328 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX2P28328 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX2P28328 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX2P28328 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX2P28328 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX2P28328 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX2P28328 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX2P28328 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX2P28328 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX2P28328 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX2P28328 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX2P28328 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX2P28328 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX2P28328 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX2P28328 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX2P28328 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX2P28328 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms