Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCD3P28288 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCD3P28288 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms