Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTFRP26992 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms