Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
YY1P25490 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
YY1P25490 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
YY1P25490 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
YY1P25490 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
YY1P25490 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YY1P25490 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YY1P25490 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YY1P25490 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YY1P25490 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
YY1P25490 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YY1P25490 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YY1P25490 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YY1P25490 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
YY1P25490 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
YY1P25490 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
YY1P25490 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
YY1P25490 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
YY1P25490 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
YY1P25490 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
YY1P25490 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
YY1P25490 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
YY1P25490 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
YY1P25490 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
YY1P25490 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YY1P25490 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YY1P25490 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YY1P25490 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
YY1P25490 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
YY1P25490 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
YY1P25490 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YY1P25490 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YY1P25490 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
YY1P25490 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YY1P25490 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
YY1P25490 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
YY1P25490 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YY1P25490 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YY1P25490 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YY1P25490 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YY1P25490 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
YY1P25490 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
YY1P25490 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
YY1P25490 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
YY1P25490 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YY1P25490 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
YY1P25490 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YY1P25490 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
YY1P25490 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
YY1P25490 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YY1P25490 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
YY1P25490 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YY1P25490 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YY1P25490 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YY1P25490 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YY1P25490 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YY1P25490 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YY1P25490 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
YY1P25490 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YY1P25490 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YY1P25490 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
YY1P25490 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YY1P25490 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
YY1P25490 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
YY1P25490 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
YY1P25490 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
YY1P25490 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
YY1P25490 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
YY1P25490 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
YY1P25490 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
YY1P25490 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
YY1P25490 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
YY1P25490 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
YY1P25490 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
YY1P25490 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
YY1P25490 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
YY1P25490 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
YY1P25490 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
YY1P25490 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
YY1P25490 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
YY1P25490 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
YY1P25490 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
YY1P25490 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
YY1P25490 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
YY1P25490 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YY1P25490 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
YY1P25490 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YY1P25490 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
YY1P25490 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
YY1P25490 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
YY1P25490 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
YY1P25490 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
YY1P25490 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
YY1P25490 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YY1P25490 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
YY1P25490 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YY1P25490 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YY1P25490 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
YY1P25490 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
YY1P25490 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms