Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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