Protein–RNA interactions for Protein: P22612

PRKACG, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACGP22612 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKACGP22612 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKACGP22612 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKACGP22612 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKACGP22612 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKACGP22612 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKACGP22612 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKACGP22612 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKACGP22612 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKACGP22612 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKACGP22612 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRKACGP22612 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRKACGP22612 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRKACGP22612 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRKACGP22612 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRKACGP22612 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKACGP22612 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms