Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms