Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRHP20396 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRHP20396 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRHP20396 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRHP20396 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
TRHP20396 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRHP20396 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRHP20396 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRHP20396 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRHP20396 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRHP20396 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
TRHP20396 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRHP20396 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRHP20396 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
TRHP20396 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRHP20396 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
TRHP20396 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRHP20396 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRHP20396 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRHP20396 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRHP20396 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
TRHP20396 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
TRHP20396 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRHP20396 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRHP20396 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRHP20396 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRHP20396 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
TRHP20396 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRHP20396 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRHP20396 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TRHP20396 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TRHP20396 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TRHP20396 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TRHP20396 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
TRHP20396 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TRHP20396 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
TRHP20396 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TRHP20396 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TRHP20396 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TRHP20396 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TRHP20396 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRHP20396 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRHP20396 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRHP20396 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRHP20396 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
TRHP20396 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRHP20396 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRHP20396 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
TRHP20396 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
TRHP20396 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRHP20396 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRHP20396 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRHP20396 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRHP20396 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRHP20396 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRHP20396 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRHP20396 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRHP20396 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRHP20396 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRHP20396 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRHP20396 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRHP20396 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRHP20396 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRHP20396 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRHP20396 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRHP20396 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRHP20396 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRHP20396 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TRHP20396 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TRHP20396 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
TRHP20396 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TRHP20396 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TRHP20396 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TRHP20396 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TRHP20396 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TRHP20396 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TRHP20396 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TRHP20396 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TRHP20396 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TRHP20396 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TRHP20396 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TRHP20396 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
TRHP20396 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TRHP20396 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TRHP20396 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TRHP20396 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TRHP20396 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TRHP20396 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TRHP20396 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TRHP20396 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TRHP20396 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TRHP20396 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TRHP20396 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TRHP20396 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TRHP20396 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TRHP20396 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TRHP20396 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TRHP20396 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TRHP20396 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TRHP20396 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms