Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
XBP1P17861 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XBP1P17861 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XBP1P17861 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XBP1P17861 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XBP1P17861 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XBP1P17861 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XBP1P17861 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XBP1P17861 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XBP1P17861 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XBP1P17861 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XBP1P17861 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XBP1P17861 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XBP1P17861 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XBP1P17861 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XBP1P17861 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XBP1P17861 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XBP1P17861 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
XBP1P17861 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
XBP1P17861 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
XBP1P17861 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
XBP1P17861 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
XBP1P17861 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
XBP1P17861 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
XBP1P17861 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XBP1P17861 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XBP1P17861 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XBP1P17861 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
XBP1P17861 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
XBP1P17861 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
XBP1P17861 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XBP1P17861 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
XBP1P17861 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XBP1P17861 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XBP1P17861 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XBP1P17861 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XBP1P17861 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XBP1P17861 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XBP1P17861 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
XBP1P17861 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XBP1P17861 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XBP1P17861 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
XBP1P17861 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XBP1P17861 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XBP1P17861 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XBP1P17861 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XBP1P17861 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XBP1P17861 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XBP1P17861 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XBP1P17861 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XBP1P17861 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XBP1P17861 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XBP1P17861 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XBP1P17861 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XBP1P17861 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XBP1P17861 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XBP1P17861 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XBP1P17861 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XBP1P17861 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XBP1P17861 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XBP1P17861 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XBP1P17861 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XBP1P17861 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XBP1P17861 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XBP1P17861 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XBP1P17861 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XBP1P17861 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
XBP1P17861 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XBP1P17861 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XBP1P17861 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XBP1P17861 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XBP1P17861 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XBP1P17861 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XBP1P17861 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XBP1P17861 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XBP1P17861 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XBP1P17861 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XBP1P17861 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XBP1P17861 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XBP1P17861 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XBP1P17861 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XBP1P17861 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XBP1P17861 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XBP1P17861 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XBP1P17861 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XBP1P17861 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XBP1P17861 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XBP1P17861 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XBP1P17861 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XBP1P17861 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XBP1P17861 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XBP1P17861 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XBP1P17861 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XBP1P17861 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XBP1P17861 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XBP1P17861 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XBP1P17861 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XBP1P17861 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XBP1P17861 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
XBP1P17861 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms