Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYN1P17600 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYN1P17600 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYN1P17600 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYN1P17600 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYN1P17600 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYN1P17600 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYN1P17600 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYN1P17600 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYN1P17600 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYN1P17600 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYN1P17600 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYN1P17600 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYN1P17600 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYN1P17600 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYN1P17600 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYN1P17600 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYN1P17600 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYN1P17600 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYN1P17600 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYN1P17600 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYN1P17600 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYN1P17600 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYN1P17600 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYN1P17600 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYN1P17600 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYN1P17600 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYN1P17600 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYN1P17600 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYN1P17600 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYN1P17600 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYN1P17600 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYN1P17600 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYN1P17600 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYN1P17600 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYN1P17600 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYN1P17600 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYN1P17600 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYN1P17600 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYN1P17600 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYN1P17600 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYN1P17600 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYN1P17600 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYN1P17600 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYN1P17600 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYN1P17600 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYN1P17600 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYN1P17600 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYN1P17600 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYN1P17600 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYN1P17600 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYN1P17600 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYN1P17600 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYN1P17600 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYN1P17600 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYN1P17600 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYN1P17600 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYN1P17600 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYN1P17600 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYN1P17600 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYN1P17600 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYN1P17600 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYN1P17600 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYN1P17600 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYN1P17600 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYN1P17600 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYN1P17600 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYN1P17600 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYN1P17600 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYN1P17600 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYN1P17600 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYN1P17600 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYN1P17600 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYN1P17600 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYN1P17600 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYN1P17600 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYN1P17600 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYN1P17600 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYN1P17600 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYN1P17600 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYN1P17600 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYN1P17600 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYN1P17600 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYN1P17600 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYN1P17600 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYN1P17600 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYN1P17600 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYN1P17600 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN1P17600 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN1P17600 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN1P17600 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN1P17600 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN1P17600 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN1P17600 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN1P17600 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN1P17600 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN1P17600 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN1P17600 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN1P17600 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN1P17600 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms