Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSPP15924 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSPP15924 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSPP15924 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSPP15924 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DSPP15924 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSPP15924 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSPP15924 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSPP15924 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSPP15924 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DSPP15924 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSPP15924 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSPP15924 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSPP15924 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSPP15924 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSPP15924 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSPP15924 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSPP15924 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSPP15924 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSPP15924 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSPP15924 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSPP15924 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSPP15924 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSPP15924 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSPP15924 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSPP15924 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DSPP15924 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSPP15924 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSPP15924 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSPP15924 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSPP15924 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSPP15924 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSPP15924 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSPP15924 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSPP15924 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSPP15924 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSPP15924 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DSPP15924 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSPP15924 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSPP15924 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSPP15924 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSPP15924 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSPP15924 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSPP15924 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSPP15924 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSPP15924 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSPP15924 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DSPP15924 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSPP15924 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSPP15924 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSPP15924 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSPP15924 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSPP15924 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DSPP15924 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSPP15924 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSPP15924 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSPP15924 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSPP15924 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSPP15924 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSPP15924 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSPP15924 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSPP15924 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSPP15924 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSPP15924 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSPP15924 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSPP15924 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DSPP15924 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSPP15924 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSPP15924 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSPP15924 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSPP15924 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSPP15924 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSPP15924 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSPP15924 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSPP15924 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSPP15924 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSPP15924 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSPP15924 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSPP15924 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSPP15924 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSPP15924 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSPP15924 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSPP15924 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSPP15924 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSPP15924 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSPP15924 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSPP15924 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSPP15924 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSPP15924 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSPP15924 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DSPP15924 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DSPP15924 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DSPP15924 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DSPP15924 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSPP15924 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSPP15924 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSPP15924 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSPP15924 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSPP15924 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSPP15924 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms