Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A1P13866 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms