Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRG2P13727 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRG2P13727 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRG2P13727 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRG2P13727 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRG2P13727 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRG2P13727 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRG2P13727 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRG2P13727 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRG2P13727 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRG2P13727 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PRG2P13727 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRG2P13727 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRG2P13727 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRG2P13727 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRG2P13727 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRG2P13727 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRG2P13727 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRG2P13727 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRG2P13727 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRG2P13727 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRG2P13727 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRG2P13727 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PRG2P13727 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRG2P13727 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRG2P13727 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRG2P13727 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRG2P13727 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRG2P13727 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRG2P13727 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRG2P13727 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRG2P13727 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRG2P13727 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRG2P13727 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRG2P13727 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRG2P13727 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRG2P13727 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRG2P13727 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRG2P13727 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRG2P13727 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRG2P13727 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRG2P13727 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRG2P13727 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRG2P13727 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRG2P13727 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRG2P13727 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRG2P13727 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRG2P13727 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRG2P13727 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRG2P13727 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRG2P13727 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRG2P13727 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRG2P13727 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRG2P13727 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRG2P13727 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRG2P13727 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRG2P13727 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRG2P13727 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRG2P13727 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRG2P13727 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRG2P13727 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRG2P13727 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRG2P13727 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRG2P13727 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRG2P13727 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRG2P13727 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRG2P13727 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRG2P13727 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRG2P13727 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRG2P13727 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRG2P13727 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRG2P13727 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRG2P13727 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRG2P13727 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRG2P13727 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRG2P13727 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRG2P13727 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PRG2P13727 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRG2P13727 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PRG2P13727 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRG2P13727 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRG2P13727 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PRG2P13727 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PRG2P13727 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRG2P13727 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRG2P13727 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRG2P13727 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRG2P13727 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRG2P13727 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRG2P13727 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRG2P13727 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRG2P13727 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRG2P13727 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRG2P13727 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRG2P13727 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRG2P13727 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRG2P13727 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRG2P13727 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRG2P13727 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRG2P13727 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms