Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms