Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms