Protein–RNA interactions for Protein: P0C7P4

UQCRFS1P1, Putative cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRFS1P1P0C7P4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UQCRFS1P1P0C7P4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UQCRFS1P1P0C7P4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UQCRFS1P1P0C7P4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UQCRFS1P1P0C7P4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UQCRFS1P1P0C7P4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UQCRFS1P1P0C7P4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UQCRFS1P1P0C7P4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UQCRFS1P1P0C7P4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UQCRFS1P1P0C7P4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UQCRFS1P1P0C7P4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UQCRFS1P1P0C7P4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UQCRFS1P1P0C7P4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UQCRFS1P1P0C7P4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UQCRFS1P1P0C7P4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UQCRFS1P1P0C7P4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UQCRFS1P1P0C7P4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UQCRFS1P1P0C7P4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UQCRFS1P1P0C7P4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UQCRFS1P1P0C7P4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UQCRFS1P1P0C7P4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms