Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN3P07498 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN3P07498 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN3P07498 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN3P07498 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN3P07498 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN3P07498 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSN3P07498 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSN3P07498 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSN3P07498 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSN3P07498 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSN3P07498 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSN3P07498 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSN3P07498 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSN3P07498 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN3P07498 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN3P07498 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN3P07498 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN3P07498 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN3P07498 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN3P07498 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN3P07498 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN3P07498 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN3P07498 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN3P07498 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN3P07498 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN3P07498 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN3P07498 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN3P07498 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN3P07498 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN3P07498 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN3P07498 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN3P07498 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN3P07498 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN3P07498 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN3P07498 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN3P07498 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN3P07498 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN3P07498 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN3P07498 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN3P07498 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN3P07498 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN3P07498 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN3P07498 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN3P07498 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN3P07498 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN3P07498 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN3P07498 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN3P07498 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN3P07498 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN3P07498 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN3P07498 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN3P07498 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN3P07498 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN3P07498 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN3P07498 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN3P07498 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN3P07498 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN3P07498 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN3P07498 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN3P07498 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN3P07498 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN3P07498 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN3P07498 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN3P07498 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN3P07498 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN3P07498 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN3P07498 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN3P07498 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN3P07498 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN3P07498 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN3P07498 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN3P07498 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms