Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APODP05090 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APODP05090 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APODP05090 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APODP05090 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APODP05090 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APODP05090 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APODP05090 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APODP05090 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APODP05090 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APODP05090 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APODP05090 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APODP05090 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APODP05090 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
APODP05090 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APODP05090 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APODP05090 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APODP05090 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
APODP05090 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APODP05090 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APODP05090 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APODP05090 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APODP05090 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APODP05090 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APODP05090 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APODP05090 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APODP05090 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APODP05090 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APODP05090 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APODP05090 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APODP05090 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APODP05090 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APODP05090 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APODP05090 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APODP05090 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APODP05090 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APODP05090 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APODP05090 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APODP05090 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APODP05090 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APODP05090 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APODP05090 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APODP05090 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APODP05090 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APODP05090 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APODP05090 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APODP05090 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APODP05090 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APODP05090 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APODP05090 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APODP05090 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APODP05090 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APODP05090 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APODP05090 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APODP05090 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APODP05090 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APODP05090 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
APODP05090 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APODP05090 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APODP05090 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APODP05090 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APODP05090 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APODP05090 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APODP05090 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APODP05090 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APODP05090 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APODP05090 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APODP05090 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APODP05090 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APODP05090 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APODP05090 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APODP05090 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APODP05090 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APODP05090 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APODP05090 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APODP05090 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APODP05090 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APODP05090 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APODP05090 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APODP05090 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
APODP05090 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APODP05090 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APODP05090 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APODP05090 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APODP05090 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APODP05090 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APODP05090 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APODP05090 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APODP05090 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APODP05090 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APODP05090 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APODP05090 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APODP05090 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APODP05090 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APODP05090 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APODP05090 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APODP05090 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APODP05090 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
APODP05090 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APODP05090 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms