Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTNP04004 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VTNP04004 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTNP04004 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTNP04004 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTNP04004 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTNP04004 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTNP04004 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTNP04004 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VTNP04004 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTNP04004 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTNP04004 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTNP04004 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTNP04004 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTNP04004 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
VTNP04004 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VTNP04004 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTNP04004 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTNP04004 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VTNP04004 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTNP04004 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VTNP04004 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VTNP04004 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTNP04004 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTNP04004 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTNP04004 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTNP04004 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTNP04004 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTNP04004 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTNP04004 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTNP04004 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTNP04004 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTNP04004 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTNP04004 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTNP04004 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTNP04004 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTNP04004 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTNP04004 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTNP04004 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTNP04004 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTNP04004 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTNP04004 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTNP04004 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTNP04004 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTNP04004 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTNP04004 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTNP04004 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTNP04004 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTNP04004 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VTNP04004 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTNP04004 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTNP04004 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTNP04004 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTNP04004 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTNP04004 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTNP04004 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTNP04004 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTNP04004 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTNP04004 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTNP04004 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTNP04004 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTNP04004 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTNP04004 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTNP04004 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTNP04004 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTNP04004 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTNP04004 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTNP04004 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTNP04004 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTNP04004 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTNP04004 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTNP04004 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTNP04004 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTNP04004 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
VTNP04004 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
VTNP04004 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
VTNP04004 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTNP04004 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTNP04004 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTNP04004 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTNP04004 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTNP04004 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTNP04004 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTNP04004 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTNP04004 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTNP04004 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTNP04004 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTNP04004 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTNP04004 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTNP04004 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTNP04004 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTNP04004 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTNP04004 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTNP04004 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VTNP04004 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTNP04004 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VTNP04004 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTNP04004 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTNP04004 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTNP04004 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms