Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MBD3O95983 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MBD3O95983 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MBD3O95983 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MBD3O95983 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MBD3O95983 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MBD3O95983 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD3O95983 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD3O95983 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD3O95983 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD3O95983 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD3O95983 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD3O95983 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD3O95983 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD3O95983 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD3O95983 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD3O95983 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD3O95983 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD3O95983 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD3O95983 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD3O95983 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD3O95983 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD3O95983 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD3O95983 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD3O95983 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD3O95983 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD3O95983 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD3O95983 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD3O95983 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD3O95983 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD3O95983 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD3O95983 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD3O95983 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD3O95983 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD3O95983 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD3O95983 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD3O95983 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD3O95983 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD3O95983 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD3O95983 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD3O95983 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD3O95983 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD3O95983 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD3O95983 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD3O95983 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD3O95983 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD3O95983 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD3O95983 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD3O95983 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD3O95983 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD3O95983 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD3O95983 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD3O95983 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD3O95983 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD3O95983 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD3O95983 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD3O95983 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD3O95983 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD3O95983 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD3O95983 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD3O95983 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD3O95983 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD3O95983 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD3O95983 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD3O95983 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD3O95983 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD3O95983 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD3O95983 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD3O95983 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD3O95983 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD3O95983 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD3O95983 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD3O95983 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD3O95983 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD3O95983 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD3O95983 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD3O95983 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD3O95983 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD3O95983 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD3O95983 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD3O95983 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD3O95983 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD3O95983 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD3O95983 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD3O95983 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD3O95983 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD3O95983 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD3O95983 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD3O95983 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD3O95983 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD3O95983 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD3O95983 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD3O95983 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD3O95983 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD3O95983 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD3O95983 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD3O95983 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD3O95983 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD3O95983 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MBD3O95983 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms