Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40AO75400 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40AO75400 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40AO75400 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40AO75400 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40AO75400 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40AO75400 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40AO75400 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40AO75400 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40AO75400 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40AO75400 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40AO75400 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40AO75400 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40AO75400 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPF40AO75400 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms