Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PITX3O75364 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITX3O75364 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITX3O75364 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PITX3O75364 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITX3O75364 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITX3O75364 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITX3O75364 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITX3O75364 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PITX3O75364 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PITX3O75364 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX3O75364 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX3O75364 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX3O75364 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX3O75364 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX3O75364 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX3O75364 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX3O75364 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX3O75364 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX3O75364 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX3O75364 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX3O75364 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX3O75364 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX3O75364 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX3O75364 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX3O75364 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX3O75364 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX3O75364 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX3O75364 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX3O75364 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX3O75364 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX3O75364 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX3O75364 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX3O75364 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX3O75364 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX3O75364 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX3O75364 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX3O75364 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX3O75364 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX3O75364 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX3O75364 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX3O75364 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX3O75364 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX3O75364 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX3O75364 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX3O75364 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX3O75364 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX3O75364 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX3O75364 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX3O75364 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX3O75364 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX3O75364 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX3O75364 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX3O75364 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX3O75364 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX3O75364 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX3O75364 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX3O75364 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX3O75364 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX3O75364 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX3O75364 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX3O75364 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITX3O75364 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms