Protein–RNA interactions for Protein: O75128

COBL, Protein cordon-bleu, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLO75128 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COBLO75128 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COBLO75128 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COBLO75128 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COBLO75128 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COBLO75128 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COBLO75128 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COBLO75128 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COBLO75128 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLO75128 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLO75128 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLO75128 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLO75128 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLO75128 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLO75128 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLO75128 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLO75128 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLO75128 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLO75128 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLO75128 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLO75128 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLO75128 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLO75128 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLO75128 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLO75128 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLO75128 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLO75128 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLO75128 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLO75128 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLO75128 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLO75128 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLO75128 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLO75128 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLO75128 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLO75128 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLO75128 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLO75128 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLO75128 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLO75128 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLO75128 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COBLO75128 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COBLO75128 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COBLO75128 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COBLO75128 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COBLO75128 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COBLO75128 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COBLO75128 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COBLO75128 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COBLO75128 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COBLO75128 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COBLO75128 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COBLO75128 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COBLO75128 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COBLO75128 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COBLO75128 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COBLO75128 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COBLO75128 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COBLO75128 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COBLO75128 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COBLO75128 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COBLO75128 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COBLO75128 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COBLO75128 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COBLO75128 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COBLO75128 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COBLO75128 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COBLO75128 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COBLO75128 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COBLO75128 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COBLO75128 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COBLO75128 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COBLO75128 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COBLO75128 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COBLO75128 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COBLO75128 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COBLO75128 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COBLO75128 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COBLO75128 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COBLO75128 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COBLO75128 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLO75128 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLO75128 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLO75128 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLO75128 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLO75128 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLO75128 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLO75128 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLO75128 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLO75128 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLO75128 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLO75128 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLO75128 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLO75128 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLO75128 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLO75128 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLO75128 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLO75128 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COBLO75128 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COBLO75128 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COBLO75128 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms