Protein–RNA interactions for Protein: O60504

SORBS3, Vinexin, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3O60504 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORBS3O60504 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms