Protein–RNA interactions for Protein: O43759

SYNGR1, Synaptogyrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1O43759 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SYNGR1O43759 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR1O43759 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR1O43759 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR1O43759 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR1O43759 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR1O43759 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR1O43759 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR1O43759 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR1O43759 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR1O43759 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR1O43759 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR1O43759 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR1O43759 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms