Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HTATSF1O43719 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms