Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATCO43716 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATCO43716 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATCO43716 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATCO43716 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATCO43716 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GATCO43716 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATCO43716 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATCO43716 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATCO43716 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATCO43716 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATCO43716 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATCO43716 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATCO43716 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GATCO43716 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GATCO43716 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATCO43716 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATCO43716 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATCO43716 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATCO43716 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATCO43716 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATCO43716 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATCO43716 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATCO43716 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATCO43716 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATCO43716 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATCO43716 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATCO43716 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATCO43716 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATCO43716 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATCO43716 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATCO43716 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATCO43716 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GATCO43716 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATCO43716 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATCO43716 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATCO43716 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATCO43716 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATCO43716 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GATCO43716 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATCO43716 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATCO43716 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATCO43716 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATCO43716 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATCO43716 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATCO43716 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATCO43716 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GATCO43716 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATCO43716 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATCO43716 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATCO43716 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATCO43716 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATCO43716 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATCO43716 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATCO43716 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATCO43716 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATCO43716 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATCO43716 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATCO43716 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATCO43716 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATCO43716 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GATCO43716 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATCO43716 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATCO43716 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATCO43716 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATCO43716 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATCO43716 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATCO43716 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GATCO43716 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATCO43716 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATCO43716 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATCO43716 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATCO43716 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATCO43716 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATCO43716 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATCO43716 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATCO43716 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATCO43716 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATCO43716 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATCO43716 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATCO43716 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATCO43716 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GATCO43716 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms