Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUPL2O15504 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms