Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX7O00628 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX7O00628 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX7O00628 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX7O00628 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX7O00628 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX7O00628 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX7O00628 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX7O00628 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX7O00628 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX7O00628 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX7O00628 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX7O00628 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX7O00628 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX7O00628 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX7O00628 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX7O00628 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX7O00628 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX7O00628 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX7O00628 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX7O00628 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX7O00628 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX7O00628 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX7O00628 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX7O00628 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX7O00628 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX7O00628 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX7O00628 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX7O00628 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX7O00628 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX7O00628 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX7O00628 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX7O00628 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX7O00628 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX7O00628 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX7O00628 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX7O00628 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX7O00628 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX7O00628 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX7O00628 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX7O00628 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX7O00628 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX7O00628 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX7O00628 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX7O00628 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX7O00628 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX7O00628 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX7O00628 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX7O00628 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX7O00628 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX7O00628 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX7O00628 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX7O00628 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX7O00628 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX7O00628 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX7O00628 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX7O00628 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX7O00628 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX7O00628 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX7O00628 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX7O00628 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX7O00628 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX7O00628 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX7O00628 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX7O00628 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX7O00628 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX7O00628 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX7O00628 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX7O00628 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX7O00628 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX7O00628 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms