Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CCER2I3L3R5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCER2I3L3R5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCER2I3L3R5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCER2I3L3R5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCER2I3L3R5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCER2I3L3R5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCER2I3L3R5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCER2I3L3R5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCER2I3L3R5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCER2I3L3R5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCER2I3L3R5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCER2I3L3R5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCER2I3L3R5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCER2I3L3R5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCER2I3L3R5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCER2I3L3R5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCER2I3L3R5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCER2I3L3R5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCER2I3L3R5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCER2I3L3R5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCER2I3L3R5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCER2I3L3R5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCER2I3L3R5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCER2I3L3R5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms