Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms