Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IQCJ-SCHIP1C9J366 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms