Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVV-1B6SEH8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms