Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
B4DXG7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
B4DXG7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
B4DXG7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
B4DXG7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
B4DXG7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
B4DXG7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
B4DXG7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
B4DXG7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
B4DXG7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
B4DXG7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
B4DXG7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
B4DXG7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
B4DXG7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
B4DXG7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
B4DXG7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
B4DXG7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
B4DXG7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
B4DXG7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
B4DXG7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
B4DXG7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
B4DXG7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
B4DXG7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
B4DXG7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
B4DXG7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
B4DXG7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
B4DXG7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
B4DXG7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
B4DXG7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
B4DXG7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
B4DXG7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
B4DXG7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
B4DXG7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
B4DXG7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
B4DXG7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
B4DXG7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
B4DXG7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
B4DXG7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
B4DXG7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
B4DXG7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
B4DXG7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
B4DXG7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
B4DXG7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
B4DXG7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
B4DXG7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
B4DXG7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
B4DXG7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
B4DXG7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
B4DXG7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
B4DXG7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
B4DXG7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
B4DXG7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
B4DXG7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
B4DXG7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
B4DXG7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
B4DXG7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
B4DXG7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
B4DXG7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
B4DXG7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
B4DXG7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
B4DXG7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
B4DXG7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
B4DXG7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
B4DXG7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
B4DXG7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
B4DXG7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
B4DXG7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
B4DXG7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
B4DXG7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
B4DXG7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
B4DXG7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
B4DXG7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
B4DXG7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
B4DXG7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
B4DXG7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
B4DXG7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
B4DXG7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
B4DXG7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
B4DXG7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
B4DXG7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
B4DXG7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
B4DXG7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
B4DXG7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
B4DXG7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
B4DXG7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
B4DXG7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
B4DXG7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
B4DXG7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
B4DXG7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
B4DXG7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
B4DXG7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
B4DXG7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
B4DXG7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
B4DXG7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
B4DXG7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
B4DXG7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
B4DXG7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
B4DXG7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
B4DXG7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
B4DXG7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms