Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPBD1B2RD01 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms