Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTL1A6NKG5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTL1A6NKG5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTL1A6NKG5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTL1A6NKG5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTL1A6NKG5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTL1A6NKG5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTL1A6NKG5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL1A6NKG5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms