Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms