Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PALM3A6NDB9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms