Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms