Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms