Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms