Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PCDHB2Q9Y5E7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms