Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms