Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPS28Q9Y2Q9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms