Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms