Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms